الطورالثاني هو أولا وقبل كل شيء تكوين أكاديمي رفيع المستوى يستهدف لتكوين إطارات في مجالات البحث أوفي أقسام البحث والتطوير ، سواء في الخدمة العامة أو في شركات القطاع الخاص ، كما هو تكوين من شأنه تشجيع إنشاء الشركات
من ناحية أخرى ، من خلال المعرفة المكتسبة والمتقنة أثناء هذا التكوين ، يتمكن الطالب بسهولة الالتحاق والاندماج في مختبرات التحليل الطبي أو مختبرات مراقبة الجودة. هذا سوف يسمح للتغلب على نقص اتقان أدوات البيولوجيا الجزيئية في الهياكل المختلفة لمراقبة الجودة والتحليل والتشخيص في البلاد
دائما في المجال التطبيقي ، يستطيع الطالب المدرّب الالتحاق بأي شركة من شركات البيوتكنولوجيا المنتجة للمواد البيولوجية ، كما يمكنه بسهولة دمج مراكز الأبحاث في التشخيص ، البيوتكنولوجيا ، الكيمياء الخضراء ، والبروتيوميات وغيرها من المراكز أو مختبرات الأبحاث التي تتعامل مع البروتينات والأحماض النووية.
يمكن للطالب أيضا مواصلة التكوين في ما بعد التدرج (دكتوراه) ليتم توظيفه كباحث ،استاذ باحث في القطاع العام (الجامعات ، مركز الأبحاث ، ...) أو في المناصب ذات المستوى المكافئ في شركات القطاع الخاص